托马斯率领的林间斗士在经历生死考验后，迎来最后的正邪较量。营救团队发现被抓走的米诺不在劫获的火车上，发现米诺深陷在 WCKD 组织的控制之中，托马斯和纽特决定前往人类最后净土营救米诺和其他人。

男孩托马斯在电梯中醒来，除了名字外什么都记不得。他来到一个被高大的石头墙包围的地方“林间空地”，与其他男孩被困在迷宫里，同时面临来自墙外的巨大怪兽威胁。