能力越大，责任越大。蜘蛛侠彼得·帕克在全力和犯罪、灾难做斗争的同时，终于迎来了毕业的时刻。可是曾经的一段心结，让他和女友格温·斯坦西的关系降至冰点。格温应聘于为全城提供电力的奥斯本集团公司，同一期间发生的两件事，不由得左右这家公司和彼得等人的命运。奥斯本的掌门人病故，他的儿子哈利以20岁的年龄接受这家市值2000亿美元的巨无霸。另一方面，极度崇拜蜘蛛侠的电力工程师麦克斯·威尔·迪伦在维修机组时意外身亡，当他再度醒来时发现自己变成了全身充满电能的超人类。

《超凡蜘蛛侠》的故事发生在彼得·帕克念高中的时候，他在小的时候就被自己的亲生父亲和母亲遗弃了。从小到大，都是他的叔叔本和姑姑梅在抚养他。而帕克自己，也在孜孜不倦地寻找着和自己身世相关的线索。终于，帕克发现了一个父亲的一个公文包，这个公文包里的线索似乎让他看到了当年他的父母遗弃自己的理由。按照公文包里的东西的提示，帕克找到了奥斯考博和科特·康纳斯博士的实验室。这个康纳斯博士是他父亲的前合作伙伴，他和帕克父母的失踪有着千丝万缕的联系。可是，他却并不着急要告诉帕克关于他父母的事情，而是要帕克变成了蜘蛛侠，而他自己则变成了蜥蜴人–他要帕克自己来寻找真相。背负着使命的帕克在正义和信念的驱使下，利用自己获得的力量，变成了一个超级英雄。