人类为了躲避巨人威胁而建筑高耸巨大城墙，躲在城墙中过着苟且偷生的日子。一天，超大型巨人来袭打破了历经百年的和平日常，纷乱中失去母亲的少年艾伦·耶格尔自此发誓要驱逐所有巨人，成为与巨人战斗的调查军团的一员。在几番赌命的险恶战斗中，艾伦得到化身为巨人的能力，一边为人类的胜利做出贡献，逐步慢慢接近世界的真相。时光流逝，来到墙外世界的艾伦选择与调查军团的伙伴们分道扬镳，执行一个惊世骇俗的恐怖计划：率领无数巨人将这个世界上所有能称之为生命的生命尽数蹂躏的“地鸣”。以三笠和阿尔敏为首的幸存者们，为了阻止意图毁灭世界的艾伦，挺身挑战最后的战役。