讲述安倍晴明学生时代的故事。在阴阳寮，被誉为天才的安倍晴明与其他学生截然不同，他是个有些讨人厌且对成为阴阳师毫无兴趣的怪人。有一天，晴明受到贵族源博雅的委托，解决袭击皇族徽子女王的怪异现象。

半夜醒来的神乐在庭院赏花时，被蝴蝶精和食梦貘的故事吸引。

日本平安时代，法力强大的阴阳师安倍晴明和搭档源博雅调查一连串奇案，牵涉其中的不只人类，还有各路妖魔孽物。这部影集以原著小说设定为蓝本，加入全新剧情，献上前所未见的晴明故事。

自有人类以来，“污秽”就不断的现身骚扰着人世间的安稳和宁静，为了对抗污秽，一群名为“阴阳师”的人们勇敢的站了出来，加入到了战斗之中，用他们的智慧和勇气守护着人类。少年焰魔堂辘轳立志要成为史上最强阴阳师，却因为一场悲剧的发生而意识到灾难的不可逆转，遂放弃了理想，沦为路人。某日，一位名叫化野红绪的京都少女出现在了辘轳的身边，两人在误打误撞之中开始了同居生活。红绪铲除污秽的决心渐渐感化了辘轳，让他再度看到了希望，燃起了热血。与此同时，辘轳发现，红绪的哥哥石镜悠斗和当年令自己失去一切的灾难有着千丝万缕的关联。